Khoa Khoa học Quản lý tiền thân là bộ môn Khoa học Quản lý, được thành lập từ năm 1977 là một đơn vị có bề dày truyền thống trong đào tạo, nghiên cứu, tư vấn về quản lý và chính sách của trường đại học Kinh tế Quốc dân. Năm 1996, Bộ môn chính thức nhận quyết định phát triển thành khoa Khoa học Quản lý, là đơn vị đầu ngành trong việc đào tạo các nhà quản lý, nghiên cứu viên, chuyên gia tư vấn, nhà hoạch định và phân tích chính sách cho các cơ quan nhà nước từ trung ương đến địa phương, các doanh nghiệp, tổ chức kinh tế - xã hội ở Việt Nam.